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NEWSSomaScan与Olink双雄对决!AG百家乐多维度实测数据揭秘
来源:尹娇美 日期:2025-03-24在众多血液蛋白质组检测技术中,除了传统的基于质谱的非靶向方法,基于亲和力平台的高通量靶向蛋白质组技术——SomaScan和Olink正迅速赢得研究者的青睐。这两种技术已为科研工作者带来了大量数据和有价值的信息,并且在不断发展与迭代中引发了激烈的竞争。目前,SomaScan已更新至11K,而Olink则更新至5K。面对这两种技术,研究者在选择时可能面临困惑。为了帮助大家更好地理解这两种技术,本文整理了近两年相关的比较研究,例如在检测稳定性、精确度、灵敏度以及蛋白检测数量和范围等方面,以供参考。
在2023年的一项研究中,科学家分析了48684位UK Biobank参与者的Olink蛋白质组数据以及35892名冰岛参与者的SomaScan数据,探讨了这些样本的蛋白质水平与基因型及表型信息之间的关系。其中1514名参与者同时进行了Olink Explore 3072和SomaScan 5K检测,研究者对此进行了详细比较。研究结果显示,两种常用的高通量蛋白质组平台所提供的信息有着重要价值,并且也揭示了它们之间的差异,这些差异在某些情况下可以提供有效的互补。经过后续更正,结果表明Olink的变异系数(CV)显著高于SomaScan,而SomaScan的精确度则更高。链接:Nature
2025年的一项研究比较了Olink Explore 3072与SomaScan 11K在4000名中国成年人中检测2168种血浆蛋白质的性能。主要结论包括:(1)两种平台测量的蛋白水平相关性较低(中位数Spearman相关系数ρ=0.29),蛋白丰度和数据质量被确认是影响相关性的关键因素,特别是Olink中检测下限以下样本的高占比影响了相关性;(2)在1694种唯/一匹配的蛋白中,Olink与SomaScan分别识别出765种和513种具有顺式蛋白数量性状位点(cis-pQTLs);(3)分别有1096种和1429种蛋白与体质指数(BMI)相关;(4)有279种和154种蛋白与缺血性心脏病(IHD)风险相关;(5)在加入传统IHD风险因素后,Olink和SomaScan的ROC AUC分别从0.845提高到0.862和0.863。这些结果展示了这两种平台的实用性,为未来研究的设计和解释提供了重要依据。链接:DOI
在2024年的一项研究中,科学家针对Atherosclerosis Risk in Communities (ARIC) Study中的102名患者的血浆,比较了SomaScan 11K与Olink Explore HT(5400+蛋白)检测的表现。主要结论包括:(1)Olink平台中超过50%的蛋白未能检测到,而SomaScan所有蛋白均高于检测下限,显示出更高的灵敏度;(2)SomaScan的CV中位数为68%,显著低于Olink HT的357%;(3)在重复样本的检测上,SomaScan表现出更好的相关性,其相关性中位数为0.85,而Olink中位数为0.65;(4)SomaScan的顺式蛋白数量性状位点绝对数量更高,约2800个,而Olink约为2100个;(5)在分析超4400个共同检测的蛋白时,相关性中位值为0.14。约三分之一的蛋白在两平台之间具有良好的相关性,其中Olink Explore HT上的匹配蛋白有约三分之一的值超出检测下限(LOD),而Olink平台大多数样本低于检测下限,严重影响了其间相关性。链接:DOI
在2025年的一项研究中,研究者利用七种蛋白质组学平台(包括SomaScan 11K、7K和Olink 5K等)对78个个体的血浆进行了综合检测和结果比较。主要结论包括:(1)七个技术平台共鉴定了13007种独特蛋白,其中SomaScan 11K和7K分别覆盖了9645个和6401个蛋白;(2)SomaScan平台的CV值为最低,显示出其是最精确和稳定的技术,11K和7K的CV中位数分别为53%和58%,而Olink平台的CV中位数则高达268%和114%;(3)在数据完整性方面,SomaScan的完整性最高,11K和7K分别为96.2%和95.8%;(4)在蛋白线性评价中,97%的SomaScan平台的蛋白处于线性范围,而Olink 5K中的这一比例仅为42%;(5)SomaScan检测到了最多的FDA批准的血浆蛋白生物标志物,覆盖率分别为88%和76%。链接:DOI
总结以上文章,涉及到大样本量的SomaScan平台与Olink平台在检测结果的比较中显示,SomaScan在整体蛋白数量和稳定性方面表现更为优越。因此,在血液大队列研究中,AG百家乐 强烈推荐SomaScan平台作为良好的选择!
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